大队现设有综合办公室、党群人事办公室、财务资产办公室、科教办公室（质量安全管理办公室）、地质灾害防治中心（驻县进乡办公室）、基础地质调查研究中心、绿色矿业研究中心、生态环境研究中心、数字化应用中心等9个内设机构。